В случае если зарплата была отправлена на счет, но не зачислена сотруднику по какой-либо причине, то для отражения возврата сумм можно воспользоваться документом "Сведения о незачисленной зарплате" (раздел Выплаты – Сведения о незачисленной зарплате):
Документ также можно создать из ведомости на выплату по ссылке Ввести сведения о незачисленной зарплате в разделе Выплата зарплаты и перечисление НДФЛ документа:
В документе Сведения о незачисленной зарплате выберете ведомость на выплату и укажите сотрудника, которому не прошла выплата. Возвращаемая сумма не указывается, т.к. считается, что вся сумма по сотруднику полностью не была зачислена:
После проведения этого документа зарплата будет считаться невыплаченной, НДФЛ неудержанным.
Для повторной выплаты необходимо будет создать новую ведомость на выплату: